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Perdu dans la migration ? Demandez votre chemin, on peut peut-être vous aider.

Ven 28 Déc, 2007 21:43

Bonsoir,

Voici donc ma situation (désolé d'avance c'est un peu long...) :

Je suis à la base un windowsien pur, autrement dit j'ai, comme beaucoup de monde, grandi avec windows (98SE au départ, puis j'ai suivi docilement jusqu'à XP au fil de mes renouvellements de PC). Cependant, plusieurs choses me font m'interroger quant à s'il vaut mieux pour moi et mon PC (et accessoirement pour pouvoir garder mon PC le plus longtemps possible) passer à Vista ou à Linux, dont la politique du présumé coupable de microsoft mais surtout le fait d'avoir reçu une formation aux bases de Linux l'année dernière (j'étais alors en licence pro de bioinformatique) et bien sûr le fait que mon Windows soit farci de logiciels libres (dont une partie trouvée sur framasoft d'ailleurs).
Si je veux pouvoir garder mon ordinateur le plus longtemps possible, cela tient autant à sa configuration (Athlon64X2 à 2.2 Ghz, 3Go de RAM et une GeForce 7500LE avec 512Mo de VRAM dédiée) qu'à mon usage actuel du PC. En effet, si jusqu'à l'an dernier, j'étais un joueur invétéré (raison de ma configuration actuelle), je ne joue presque plus maintenant sur PC, ayant une console pour ça (et encore je ne joue dessus que très rarement depuis 6 mois environ) ce qui me laisse penser que le jeu sur PC (voire les jeux vidéo tout court) ne m'est plus aussi indispensable qu'auparavant. Donc, aujourd'hui, mon utilisation du PC se limite principalement à de la bureautique/internet d'une part, de la lecture et de l'encodage de vidéos (mais bon, de 10 minutes maximum les vidéos) et à l'utilisation de quelques logiciels de bioinformatique (suite genomatix, blast...). Concernant ces derniers, tous sont soit originaires du monde Linux et libres (licence GPL, et alors pas toujours portés sous windows) soit existent pour les deux systèmes (ça concerne surtout les softs propriétaires payants tels que Genomatix), soit en sont indépendants (car s'utilisent via une interface web), donc aucun problème à prévoir (il existe d'ailleurs une distribution Linux spécialisée, Bioknoppix, pour la biologie moléculaire et la bioinformatique, que certains de nos professeurs nous avaient conseillé d'essayer, c'est pour dire!). A vrai dire, pour la bioinformatique, ce serait plutôt Windows qui est en retard sur Linux.

J'ai par conséquent commencé par tester tous les Live CD installables et proposant la langue française (ça j'y tiens beaucoup, je n'ai pas envie de devoir continuellement traduire les menus pour utiliser mon système) que j'ai pu trouver sur Distrowatch. Bilan : seules Ubuntu et fedora (et leurs déclinaisons et dérivées) reconnaissent mon matériel "out of the box". N'aimant que moyennement fedora, mon choix de distribution en cas de passage à Linux est tout trouvé (sauf si je trouve moyen d'en avoir une avec une aussi bonne détection matérielle mais basée sur E17, que j'aime beaucoup niveau look). Mais, même après avoir posté sur le forum Linux de malekal.com (dont une utilisatrice m'a orienté ici), je me pose encore quelques questions quant à la capacité de cette distribution à remplacer Windows chez moi, et en particulier sur son inocuité sur mon disque dur, ayant vu qu'il y a un bug dans cette distribution qui détruirait les disques durs ici : https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/acpi-support/+bug/59695. Ce bug est d'ailleurs la dernière chose qui m'empêche de franchir le pas, mon matériel étant intégralement reconnu par cette distribution (y compris ma toute nouvelle souris, facilement configurable sous Linux via une petite modification du fichier de configuration de xorg très bien expliquée dans la documentation d'Ubuntu, que mon PC n'a cependant pas l'air d'aimer lui puisqu'il ne démarre pas si la souris est branchée lors du boot, à n'y rien comprendre, surtout qu'elle marche bien une fois branchée sous Windows) et tous les logiciels que j'utilise ayant un équivalent sous Linux. Alors certes, d'après la documentation d'Ubuntu, cela n'affecte que les portables et mon PC est une tour classique, mais je n'ai guère confiance, d'autant que comptant supprimer Windows lors de ma migration, il sera trop tard si je détectais ce bug une fois celle-ci efffectuée pour revenir sous Windows (n'ayant pas le CD de ce dernier, situation due à un OS préinstallé). J'ai essayé de suivre les indications données dans la documentation d'Ubuntu pour détecter si ce bug est présent mais cela ne donne rien vu qu'il me manque le paramètre le plus important (le load cycle count en l'occurence). Qu'en pensez-vous?

Désolé d'avoir été si long mais je voulais être aussi clair et détaillé que possible, et merci d'avance!
floflo63

Messages : 62
Géo : Lempdes

Ven 28 Déc, 2007 22:04

:D bah voilà c'est vrai que ton post est long mais au moins on a de l'info !

dis-moi, c'est quoi la bioinformatique? :-|

Je n'en ai aucune idée !
"A mon avis chez Microsoft ils sont infiniment plus doués pour faire du fric que pour élaborer des systèmes d'exploitation performants." Linus Torvalds
http://fr.wikipedia.org/wiki/Mepis
Linux User # 415016
Jess

Messages : 1252
Géo : Palaiseau

Ven 28 Déc, 2007 22:06

Mais, même après avoir posté sur le forum Linux de malekal.com (dont une utilisatrice m'a orienté ici)


Bonsoir floflo63,
Je pense que certaines des questions que tu as posées auront avantage à être vues par plus de monde que juste deux ou trois linuxiens, déjà pour ce bug sur la fréquence des accès disques, et puis aussi pour essayer de comprendre pourquoi certains des CD live que tu as essayés, comme Mépis (coucou Jess !) "ne fonctionnent pas".

(Il faudra être un peu précis et donner des indications claires sur ce qui se passe quand "ça ne marche pas", si c'est durant le boot à quel moment ça s'arrête, etc... )

En espérant que tu auras beaucoup de réponses, et te souhaitant une bonne migration !
LinuxVillage - http://linuxvillage.org
Site d'entraide d'utilisateurs GNU/Linux
Mélodie

Messages : 4555
Géo : France

Ven 28 Déc, 2007 22:09

Athanor1 a écrit: (...) et puis aussi pour essayer de comprendre pourquoi certains des CD live que tu as essayés, comme Mépis (coucou Jess !) "ne fonctionnent pas".

(Il faudra être un peu précis et donner des indications claires sur ce qui se passe quand "ça ne marche pas", si c'est durant le boot à quel moment ça s'arrête, etc... )

En espérant que tu auras beaucoup de réponses, et te souhaitant une bonne migration !


Oué tiens? :?

Tu as essayé quelle version, la 7.0 ?
"A mon avis chez Microsoft ils sont infiniment plus doués pour faire du fric que pour élaborer des systèmes d'exploitation performants." Linus Torvalds
http://fr.wikipedia.org/wiki/Mepis
Linux User # 415016
Jess

Messages : 1252
Géo : Palaiseau

Sam 29 Déc, 2007 10:27

Salut,

dis-moi, c'est quoi la bioinformatique?


C'est assez vaste, mais on peut diviser ça en deux parties distinctes :
-la création de logiciels utiles aux biologistes (moléculaires et phylogénistes principalement), donc de la programmation (pas ma tasse de thé, ayant une formation de biologie à la base), souvent appelée bioinformatique (je sais, c'est pas logique mais bon)
-l'utilisation de ces logiciels sur des données biologiques pour en déduire des informations compréhensibles par un biologiste, aussi appelée bioanalyse (ma spécialité en l'occurrence)
La difficulté, c'est qu'un bioinformaticien ou bioanalyste doit connaître suffisamment de biologie pour comprendre ce dont a besoin le biologiste, suffisamment d'informatique pour comprendre les algorithmes des logiciels qu'il utilise (voire assez pour pouvoir en coder, mais bon c'est loin d'être mon cas), et surtout sert d'interface entre le biologiste et l'informaticien du service (en gros, expliquer ce que veut le biologiste à celui-ci et traduire ce dont a besoin l'informaticien en termes biologiques pour que le biologiste comprenne et lui donne).


Tu as essayé quelle version, la 7.0 ?


Oui (version 7.0 32 bits), mais ce problème était déjà présent sur la 6.5, que j'ai essayée à sa sortie (je commençais déjà à me demander si je n'allais pas laisser tomber Windows à l'époque, mais il m'aura fallu attendre d'avoir eu une formation de base à Linux et de trouver une distribution voulant bien de mon matériel pour me décider). Je n'ai jamais pu démarrer cette dernière d'ailleurs et avais abandonné après 10 essais (ayant un iso dont j'avais vérifié le md5). Le problème, que ce soit avec la 6.5 à l'époque ou la 7.0 aujourd'hui, se pose juste après l'écran de choix de la langue et de la résolution, une fois que je lui demande de lancer mepis : j'ai une suite d'erreurs I/O, puis une suite d'erreurs dans le système de fichiers SquashFS qui n'arrive pas à lire certains secteurs du disque semble-t-il, et cela en boucle et le PC ne démarre pas, je suis obligé de l'éteindre avec le bouton de démarrage.
De plus, seul le Live CD de Mepis me fait ça, tous les autres que j'ai essayés démarrent sans problème au premier essai (même si beaucoup ne reconnaissent que très partiellement mon matériel après, mais c'est un autre problème). Pour ce qui est de la qualité de CD, il s'agit de CD-RW (plus pratique que d'acheter des brouettes de CD vierges, surtout vu le nombre de distributions que j'ai essayé, et moins cher aussi) Verbatim que j'efface complètement (et pas que la TOC) avant chaque réutilisation. Mais je doute un peu que ce soit le CD puisque j'avais gravé fedora dessus sans problème et le PC a bien démarré dessus.
floflo63

Messages : 62
Géo : Lempdes

Sam 29 Déc, 2007 10:57

Bonjour floflo63,

Pourrais-tu lancer le live CD Ubuntu et copier un contenu complet de 'sudo lswh' ici s'il te paît ? Puis essayer de nous dire quelles parties de ce matériel ne sont pas reconnues par les distributions autres-que-Ubuntu et Fedora. (Généralement on parle de problèmes avec les winmodems, les modems usb, les imprimantes, parfois les scanners, des questions relatives aux pilotes de cartes graphiques, pour le reste c'est assez rare, de là ma question).

À tout hasard, lances aussi un 'free', et copies ce résultat ici, juste au cas où.

man free a écrit:FREE(1) Linux User's Manual FREE(1)

NAME
free - Display amount of free and used memory in the system
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Mélodie

Messages : 4555
Géo : France

Sam 29 Déc, 2007 13:40

re

oh si ça mer..oie dès le lancement du noyau ça sent le lecteur de cd-rom capricieux. Si L'amorçage se fait mais qu'après il n'arrive pas à trouver le lecteur de cd.... tu n'aurais pas un contrôleur IDE JMicron par hasard? Chipset Intel 965 ou quelque chose du genre?
"A mon avis chez Microsoft ils sont infiniment plus doués pour faire du fric que pour élaborer des systèmes d'exploitation performants." Linus Torvalds
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Linux User # 415016
Jess

Messages : 1252
Géo : Palaiseau

Sam 29 Déc, 2007 15:42

Salut,

Voici les résultats des commandes demandées. Pour commencer, le plus court, free :

total used free shared buffers cached
Mem: 3116304 637364 2478940 0 91028 369356
-/+ buffers/cache: 176980 2939324
Swap: 0 0 0

Et le long, sudo lshw :

ubuntu
description: Desktop Computer
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vendor: Acer
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description: CPU
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description: CPU
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description: L1 cache
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clock: 66MHz
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product: MCP61 SMBus
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description: USB Controller
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description: USB Controller
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product: MCP61 PCI bridge
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description: Multimedia controller
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*-ide
description: IDE Channel 0
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description: HPFS/NTFS partition
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description: IDE interface
product: MCP61 SATA Controller
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version: 1.00
capabilities: removable
*-disc
physical id: 0
logical name: /dev/sde

Avec la plupart des distributions, ce qui coince, c'est ma carte réseau, non reconnue : du coup pas d'internet utilisable en mode Live, auquel cas je n'ai pas cherché plus loin, c'était changement de distribution (parce que si une simple carte ethernet n'est pas reconnue, ça en dit long je pense sur le support matériel de la distribution, mais là j'ai peut-être conclu trop vite...). Il me semble pourtant qu'elle est assez standard (après tout, c'est une bête carte ethernet...). Je passe sur les distributions qui ne reconnaissent pas la moitié de mon matériel (d'après les infos système qui me sont données par le système en mode Live et qui comportent beaucoup trop d'erreurs de reconnaissance ou d'absence de reconnaissance à mon goût, telles que knoppix entre autres dont je n'ai plus les noms en tête). Dans certains cas, comme fedora d'ailleurs, c'est mon écran qui ne l'est pas (assez embêtant quand même..). Il m'a en effet fallu lui spécifier manuellement que mon écran aimait bien le 1024X768 pour pouvoir y avoir accès (sinon c'était 640X480 obligatoire ou 800X600 selon les distributions, pas pratique), ce qui m'a fait un peu bizarre d'ailleurs vu que c'était la première fois que ça m'arrivait.

Voilà, j'en profite tant que je suis en mode Live CD pour me faire une sauvegarde de mon MBR (peut toujours être utile...) et je retourne réviser.
floflo63

Messages : 62
Géo : Lempdes

Sam 29 Déc, 2007 16:42

re

moi à mon humble avis le problème vient du chipset nforce2 nvidia de la carte mère, pas de ta carte Ethernet. Je parie que tu la mets sur n'importe quelle autre carte mère avec un chipset Intel ou Via ou SiS, elle sera détectée.

Je vois aussi une carte SD (mémoire flash)?
*-disk:0
description: SCSI Disk
product: Compact Flash
vendor: Generic-
physical id: 0.0.0
bus info: scsi@4:0.0.0
logical name: /dev/sdb
version: 1.00
capabilities: removable
*-disc
physical id: 0
logical name: /dev/sdb
*-disk:1
description: SCSI Disk
product: SM/xD-Picture
vendor: Generic-
physical id: 0.0.1
bus info: scsi@4:0.0.1
logical name: /dev/sdc
version: 1.00
capabilities: removable
*-disc
physical id: 0
logical name: /dev/sdc
*-disk:2
description: SCSI Disk
product: SD/MMC
vendor: Generic-
physical id: 0.0.2
bus info: scsi@4:0.0.2
logical name: /dev/sdd
version: 1.00
capabilities: removable

Ça correspond à quoi? Un lecteur de cartes?

Pour l'écran : tu as une carte vidéo Nvidia 7500 LE c'est ça?

*-display
description: VGA compatible controller
product: G72 [GeForce 7500 LE]
vendor: nVidia Corporation
physical id: 0
bus info: pci@0000:02:00.0
version: a1
width: 64 bits
clock: 33MHz
capabilities: pm msi pciexpress vga bus_master cap_list
configuration: latency=0
"A mon avis chez Microsoft ils sont infiniment plus doués pour faire du fric que pour élaborer des systèmes d'exploitation performants." Linus Torvalds
http://fr.wikipedia.org/wiki/Mepis
Linux User # 415016
Jess

Messages : 1252
Géo : Palaiseau

Sam 29 Déc, 2007 16:48

floflo63 a écrit:Salut,

Voici les résultats des commandes demandées. Pour commencer, le plus court, free :

total used free shared buffers cached
Mem: 3116304 637364 2478940 0 91028 369356
-/+ buffers/cache: 176980 2939324
Swap: 0 0 0


Grosse ram !

Et le long, sudo lshw :
[...]
*-network
description: Ethernet interface
product: 88E8056 PCI-E Gigabit Ethernet Controller
vendor: Marvell Technology Group Ltd.
physical id: 0
bus info: pci@0000:03:00.0
logical name: eth0

[...]

Avec la plupart des distributions, ce qui coince, c'est ma carte réseau, non reconnue


Apparemment, ça se configure avec ndiswrapper, comme on peut le voir sur ce fil de discussion du forum Ubuntu, où celui qui poste là a justement la même carte que la tienne. :)

Je passe sur les distributions qui ne reconnaissent pas la moitié de mon matériel (d'après les infos système qui me sont données par le système en mode Live et qui comportent beaucoup trop d'erreurs de reconnaissance ou d'absence de reconnaissance à mon goût, telles que knoppix entre autres dont je n'ai plus les noms en tête).


Knoppix est une distribution nomade, et même si certains l'installent ce n'est pas construit pour, au départ. De plus note que hormis Ubuntu, la plupart des distributions qui ont eu produit un live CD, la produisaient davantage dans un but de démonstration que dans un but de détection du matériel. Résultat, Ubuntu est l'une des plus en avance sur ce point. (Je n'ai pas fait d'essais avec des live CD cette année, donc j'ignore ce qu'il en est maintenant de Mandrake move ou son équivalent, etc... j'ai juste essayé la version live de Archlinux en machine virtuelle).
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Mélodie

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