Mmh non, avec TrueCrypt c'est plutôt transparent, tu peux sans problème naviguer sur un volume chiffré sans voir de différence (exemple : regarder en direct une vidéo chiffrée, c'est possible).
Mais c'est réellement le seul moyen : si le disque n'est pas chiffré, les données sont en clair et sont donc lisibles quoi qu'il arrive. En admettant que tu poses un système de mot de passe, tu n'as aucun moyen de forcer l'utilisateur a passer par ce mot de passe.
Très honnêtement, le chiffrement ça n'a pas beaucoup d'impact sur les performances, et ça me semble être exactement ce qui est recherché là