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Gros projet demande de l'aide!

Tout ce qui est un peu hors-sujet mais qui peut se partager...

Dim 05 Nov, 2006 16:28

Bonjour à tout le monde,
Voila, je vais essayer de faire simple et concis.

Je suis étudiant en Biologie, et j'ai un projet qui consisterai à créer un site où l'on pourrait se "promener" à l'intérieur de la cellule, à des grossisssement plus ou moins élevés.

Le projet serait bien sûr ouvert à tous, et éditable à la mode Wiki, en ce sens que n'importe qui pourrait ajouter des entrées pour compléter le schéma, fair des liens vers des articles, etc.

Je ne sais absolument pas comment lancer un tel projet, et je suis ouvert à toutes suggestions.

JB
jbl

Messages : 2

Dim 05 Nov, 2006 23:36

jbl a écrit:... où l'on pourrait se "promener" à l'intérieur de la cellule, à des grossisssement plus ou moins élevés.

JB


Le Voyage fantastique, de Richard Fleischer.
Avec Raquel Welch ...

Image
plakat

Messages : 55

Lun 06 Nov, 2006 00:26

A part énumérer les compétences qu'un tel site me paraît demander, je ne peux pas faire grand-chose pour toi...

A mon avis, il va te falloir l'aide d'un infographiste...
Pour la conception du site, consulte la logithèque de Framasoft (je sais, ça fait un peu "Dém****-toi", mon histoire, mais je ne suis pas assez compétent pour t'offrir mon aide ! Sinon, je serais déjà en train de bosser avec toi, crois-le bien...) : le choix y semble large (nvu, Seamonkey...).
Je vais expliquer ton cas à une infographiste que je connais sur un autre forum. J'espère pour toi qu'elle sera intéressée... Si elle est intéressée, je te demanderai par message privé une adresse E-Mail ou de messagerie instantanée, afin que vous puissiez, elle et toi, vous contacter. Je ne garantis pas sa disponibilité, mais... je la contacte et on verra bien.

C'est un site qui promet d'être passionnant à visiter ! Je te souhaite bon courage...

Je te tiens au courant pour cette infographiste. Plusieurs tchats avec elle me font dire qu'elle est sympa et que votre coopération devrait bien se passer.
Raphaël53

Messages : 194
Géo : Laval (53)

Lun 06 Nov, 2006 10:46

Je pense qu'il y a de points à préciser : But du site (vulgarisation, professionnel, jeunesse …) Public visé … (spécialistes, grand public …) etc

Ensuite on peut penser à une forme, aux moyens à utiliser (textes, photos, dessins … ) Je pense qu'il existe du matériel graphique libre de droits.

( Le Voyage fantastique *, un film d'espionnage, était en même temps une jolie manière de parler et de montrer l'intérieur du corps humain. )

Les contraintes : délais, savoir-faire, éventuels moyens matériels et techniques.

Et puis, stylo, papier. Un scénario (même succinct) est très utile. Là on peut commencer à voir plus clair et à prendre des options sur le type de site qu'on veut faire.


Cordialement




* avec Raquel Welch …
plakat

Messages : 55

Lun 06 Nov, 2006 18:48

Salut jbl

Tu peux jeter un coup d'oeil sur ce qui se fait sur le wiki de Linux-Tarn Albi ( https://193.50.91.122/wiki2/ ) à l'adresse suivante : https://193.50.91.122/wiki2/wakka.php?wiki=PhpJmolPlug
Toutes les informations sur le site http://jmol.sourceforge.net
Tu peux contacter directement Denis Defolie sur le wiki pour le projet Jmol.
Tout le monde est bienvenu.
Cordialement
LM
HelLo

Messages : 4

Lun 06 Nov, 2006 21:59

L'infographiste est partante... mais peu disponible. J'espère donc que le projet n'urge pas !
Jbl, tu peux donc me communiquer par message privé où, quand et comment te joindre.
Raphaël53

Messages : 194
Géo : Laval (53)

Mer 22 Nov, 2006 22:06

Merci pour les commentaires!


>de plaka

>Je pense qu'il y a de points à préciser : But du site (vulgarisation, professionnel, jeunesse …) Public visé … >spécialistes, grand public …) etc

Le but du site est de créer une base de données à la wikipedia permettant à tout le monde d'accéder "dans la cellule" , de s'y balader, et de visualier tout ce qu'y s'y passe (réplication de l'ADN, interaction protéines-protéines...).
Comme il s'agit d'un projet à la wikipédia, cela impliquerait d'avoir à disposition de l'utilisateur lambda une sorte de trousse à outils qui lui permetraient de "dessiner" les protéines, l'ADN, bref, toutes les molécules, à des grossissements qui conviendraient (On ne va pas dessiner un chromosome à l'échelle atomique par exemple, mais si quelqu'un a besoin de voir une région particulière de l'ADN, il pourrait "zoomer" dessus, exactement à la google-Earth, et au besoin, dessiner la partie non représentée.)

Le publique visé, comme tu le dis, est le plus large au monde. Tout le monde pourrait s'y retrouver, autant le lycéen que le docteur le plus titré du monde...). Le but étant que ceux qui le peuvent puissent apporter leur pierre dans l'édifice.

>Ensuite on peut penser à une forme, aux moyens à utiliser (textes, photos, dessins … ) Je pense qu'il existe du >matériel graphique libre de droits.

Le but serait d'utiliser quelque chose de type Jmol ou similaire...


>Les contraintes : délais, savoir-faire, éventuels moyens matériels et techniques.

Comme c'est un projet que j,ai en tête depuis quelques années, ce n'est pas grave si ce n'est pas fait demain, mais comme tout projet, s'il avance, ca sera de la balle!

>Et puis, stylo, papier. Un scénario (même succinct) est très utile. Là on peut commencer à voir plus clair et à prendre >des options sur le type de site qu'on veut faire.

Ok, alors, en gros :
I) il faut un moteur de rendu 3d qui soit simple et efficace, dans lequel on puisse se déplacer simplement, ou l'on puisse zoomer sur des points précis, et qui permettent l'édition.
Exemple : Je connais un mécanisme qui se déroule dans la cellule, mais personne ne l'a exposé clairement, alors, je vais utiliser des outils d'édition 3d pour pouvoir compléter l'ensemble, puis le rendre disponible aux yeux de tout le monde.
II) Il faut des outils virtuels, permettant de creer tout ce qui existe dans une cellule : Cela part des molécules tels l'eau (là, je sais que les visualisateurs 3d comme Jmol sont très biens) et cela va jusqu'à des compartiments de la cellule, comme de réticulum endoplasmique ou le noyau de la cellule.
III) il faut, par exemple, losque l'on clique droit sur une molécule, qu'un menu contextuel apparaisse, et nous permette d'accéder à d'autres informations (exemple, une enzyme, on va pouvoir afficher :Nom, caractéristiques, recherche dans PubMed (un annuaire de toutes les publications en science), le Kd, etc...)

Voici en gros à quoi resemble le projet.

Désolé de répondre si tard,

JBL
jbl

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