Avant de fignoler les détails dans un style .bst*, un simple \textit{blabla} directement sous JabRef dans la case titre devrait faire l'affaire. Par exemple, un titre donnerait :
Survival rates and causes of mortality in {E}urasian lynx (\textit{{L}ynx lynx}) in multi-use landscapes
Les accolades autour du {E} de Eurasian et autour du 1er {L} de Lynx permettent de conserver la majuscule dans la référence mise en forme par BibTeX sous LaTeX.
* Pour lequel je te conseille d'utiliser le package 'natbib' et le style 'apalike' avec simplement dans le préambule :
- Code: Tout sélectionner
\usepackage{natbib}
\bibliographystyle{apalike}
et à l'endroit où tu veux placer la liste biblio :
- Code: Tout sélectionner
\bibliography{biblio}
où 'biblio' est le nom (voir le chemin du style chemin/biblio) de ton fichier de bibliographie, sans l'extension .bib.
EDIT : bon, j'arrive trop tard, j'espère que le reste peut t'aider quand même
(ah et puis j'utiliserais plutôt \textit{} qui définit précisément que la partie entre accolades doit être en italique, que \emph{} qui dit juste qu'elle doit être mise en avant. LaTeX interprète ça comme de l'italique et à la fin, le résultat est le même j'en conviens.

)